50. Konkurs na stanowisko asystenta w Laboratorium Genomiki i Bioinformatyki

 KONKURS NA STANOWISKO

 ASYSTENTA

 W INSTYTUTCIE IMMUNOLOGII I TERAPII DOŚWIADCZALNE

im. Ludwika Hirszfelda

POLSKIEJ AKADEMII NAUK WE WROCŁAWIU

 

INFORMACJE OGÓLNE DOTYCZĄCE STANOWISKA PRACY

  1. Stanowisko asystent
  2. Liczba stanowisk objętych konkursem 1
  3. Jednostka organizacyjna Instytutu Laboratorium Genomiki i Bioinformatyki
  4. Źródło finansowania środki Instytutowe
  5. Wynagrodzenie brutto: –
  6. Rozdaj umowy umowa o pracę
  7. Wymiar zatrudnienia 1/1 etatu
  8. Okres zatrudnienia od 12.2025 – do Kliknij lub naciśnij, aby wprowadzić datę.
  9. Proponowany termin rozpoczęcia pracy 12.2025
  10. Całkowity koszt przewidziany na zatrudnienie pracownika[1] (jeśli zatrudnienie z projektów)
  11. OPIS ZADAŃ NA STANOWISKU

Prowadzenie prac badawczych z wykorzystaniem wysokoprzepustowego sekwencjonowania uwzględniając sekwencjonowanie nanoporowe obejmuje kompleksowe działania związane z analizą kwasów nukleinowych pochodzących z różnorodnych materiałów biologicznych, takich jak tkanki, linie komórkowe, próbki kliniczne czy mikrobiom. W ramach tych prac realizowane jest przygotowanie bibliotek, optymalizacja protokołów izolacji DNA i RNA oraz dobór odpowiednich metod analitycznych w zależności od celu badania, np. charakterystyki zmienności genetycznej, profilu ekspresji genów. Szczególne miejsce zajmuje sekwencjonowanie nanoporowe (Oxford Nanopore Technologies), które umożliwia uzyskanie bardzo długich odczytów sekwencji, co pozwala na precyzyjną analizę struktury genomów, identyfikację rearanżacji chromosomalnych, haplotypów oraz badanie metylacji DNA w sposób bezpośredni. Równolegle prowadzone będą analizy bioinformatyczne, obejmujące kontrolę jakości danych, ich mapowanie do genomów referencyjnych, wykrywanie wariantów oraz integrację wyników z danymi klinicznymi i funkcjonalnymi.

Prowadzenie prac badawczych opartych o techniki edycji genów obejmujące projektowanie i realizację eksperymentów mających na celu wprowadzanie modyfikacji w materiale genetycznym komórek lub organizmów modelowych. W tym zakresie wykorzystywane będą nowoczesne narzędzia inżynierii genomowej, takie jak system CRISPR/Cas9, nCas i dCas, a także edytory zasad (base editors) oraz edytory pierścieniowe (prime editing). Do kluczowych zadań będzie należał dobór sekwencji gRNA, konstrukcja wektorów ekspresyjnych, wprowadzanie systemów edycji do komórek metodami transfekcji lub zakażeń wirusowych oraz selekcja i walidacja komórek zmodyfikowanych genetycznie. Analizy potwierdzające efektywność edycji będą obejmować m.in. sekwencjonowanie „on-target”, ocenę poziomu ekspresji genów, badania białek oraz ocenę zmian fenotypowych komórek.

  1. WYMAGANIA STAWIANE KANDYDATOM
  2. Wymagania formalne i merytoryczne które powinien spełnić Kandydat (zgodnie z § 4 ust 3 lit k oraz § 4 ust 4 Regulaminu przeprowadzania konkursów na stanowiska naukowe w IITD PAN)

Kandydat aplikujący na ogłaszane stanowisko naukowe powinien wykazywać się silną motywacją do pracy naukowej, umiejętnością pracy w zespole, samodzielnością, odpowiedzialnością i zaangażowaniem w realizację zaplanowanych zadań.

W szczególności Kandydat powinien[2]:

  1. posiadać tytuł lub stopień w dziedzinie/dyscyplinie (lub dziedzinie pokrewnej), – biologia molekularna, eksperymentalna lub analityka medyczna
  1.  posiadać co najmniej 5 letnie doświadczenie pracy naukowej,
  2. Wykazać dorobek publikacyjny w tym przynajmniej 1 publikację, w której pełni rolę wiodącą (pierwszy, lub ostatni lub korespondencyjny autor),
  3. posiadać wiedzę i doświadczenie w planowaniu i prowadzeniu badań naukowych w zakresie hodowli komórek ludzkich i bakterii, inżynierii genetycznej z wykorzystaniem CRISPR/Cas9 i edytorów zasad (BEs), manipulacji genów bakteryjnych i eukariotycznych, sekwencjonowania krótkich i długich odczytów;
  4. posiadać wiedzę i doświadczenie w zakresie zastosowania transfekcji komórek ludzkich, syntezy mRNA in vitro, mikroskopii fluorescencyjnej, klonowania plazmidów, ekspresji białek w systemach bakteryjnych, projektowania gRNA, przygotowywania bibliotek i sekwencjonowania w technologii Illumina i Oxford Nanopore Technologies, ekstrakcji DNA i RNA z komórek ludzkich, analizy danych z sekwencjonowania amplikonowego, plazmidów i transkryptomu. Mile widziane doświadczenie w obsłudze specjalistycznych programów do analizy danych, m.in. EPI2ME, SAV, SnapGene, IGV, Cytoscape, GSEA, CRISPResso. Dodatkowym atutem będzie znajomość podstaw programowania w języku Pyton, R, bash lub pokrewnych.
  5. wykazać czynny udział w życiu naukowym udokumentowany przedstawieniem wyników własnych badań w publikacjach naukowych, w tym przynajmniej w 2 publikacjach oryginalnych posiadających IF w których Kandydat jest autorem pierwszym/równorzędnym z pierwszym/ostatnim opublikowanych w okresie 5 lat przed złożeniem aplikacji w konkursie
  6. udokumentować czynny udział w realizacji projektów naukowych w roli wykonawcy projektów
  7.  wykazać udział w opiece nad młodszą kadrą naukową (?)
  8. udokumentować odbyte staże naukowe w więcej niż jednej jednostce naukowej/badawczej
  9. wykazać czynny udział w popularyzacji nauki
  10. posługiwać się językiem angielskim w mowie i piśmie,
  11. przedstawić certyfikat potwierdzający przeszkolenie do przygotowywania bibliotek i sekwencjonowania długich odczytów w technologii ONT

 

  1. Dodatkowe umiejętności i doświadczenie kandydata mile widziane na stanowisku (zgodnie z § 4 ust 3 lit k Regulaminu przeprowadzania konkursów na stanowiska naukowe w IITD PAN) (do uzupełnienia przez Wnioskodawcę)
  2. WYKAZ DOKUMENTÓW WYMAGANYCH OD KANDYDATA[3]:

Szczegółowe rekomendacje minimalnych wymagań formalnych stawianych osobom ubiegającym się w drodze konkursu o zatrudnienie na stanowiskach naukowych w Instytucie Immunologii i Terapii Doświadczalnej PAN są określone w Załączniku nr 1 Regulaminu przeprowadzania konkursów na stanowiska naukowe w IITD PAN. Ocena Kandydatów zostanie przeprowadzona w oparciu o Formularz Oceny Kandydata (Załącznik nr 2 do Regulaminu).

  1. kopia dyplomu poświadczająca uzyskanie tytułu zawodowego lub stopnia naukowego lub tytułu profesora w dziedzinach i dyscyplinach nauk wskazanych w konkursie
  2. list motywacyjny
  3. CV przedstawiające sylwetkę naukową kandydata (m.in. przebieg kariery zawodowej, przerwy w karierze, jeśli kandydat uzna za zasadne je podać, publikacje z opisem wkładu kandydata w ich powstanie, odbyte praktyki, staże, szkolenia, warsztaty, udział w realizacji lub kierowanie grantami, opieka nad młodszą kadrą naukową, promotorstwo doktorantów, popularyzacja nauki).
  4. opis najważniejszego osiągnięcia naukowego/najważniejszych osiągnięć naukowych
  5. przedstawić plan badawczy
  6. Inne dokumenty potwierdzające wymagania (np. listy polecające, certyfikaty etc.)
  7. INFORMACJE DOTYCZACE TERMINÓW I TRYBU SKŁADANIA DOKUMENTÓW I KONTAKTU Z KANDYDATAMI

Konkurs jest prowadzony zgodnie z Regulaminem przeprowadzania konkursów na stanowiska naukowe w Instytucie Immunologii i Terapii Doświadczalnej im. Ludwika Hirszfelda Polskiej Akademii Nauk. Dokumentacja konkursowa dostępna jest na stronie  https://hirszfeld.pl/instytut/oferty-pracy/zasady-zatrudniania-na-stanowiskach-naukowych/

Zgłoszenia zawierające komplet dokumentów powinny zostać dostarczone do dnia 5.12.2025 r. do godz. 15:00 pocztą elektroniczną na adres kadry@hirszfeld.pl (tytuł aplikacji: asystent LGiB). Kontakt z Kandydatami będzie się odbywał za pośrednictwem poczty elektronicznej na adres, z którego zostanie wysłane zgłoszenie lub w inny, uzgodniony z Kandydatem sposób.

Informujemy, że skontaktujemy się z wybranymi Kandydatami, którzy zostaną zaproszeni na rozmowę kwalifikacyjną (osobiście lub on-line). Rozstrzygnięcie konkursu nastąpi do dnia 15.12.2025, a o wynikach konkursu Kandydaci zostaną powiadomieni pocztą elektroniczną. Komisja zastrzega sobie prawo do nie wybrania żadnego z Kandydatów w drodze konkursu. W takim przypadku konkurs może zostać/zostanie ogłoszony ponownie.

Jeśli Kandydat wyraża zgodę na wykorzystanie zgłoszenia w następnych naborach, prosimy o dołączenie oświadczenia o treści „Wyrażam zgodę na przechowywanie dokumentów i ich wykorzystanie w następnych naborach zgodnie z § 11 ust. 2 Regulaminu przeprowadzania konkursów na stanowiska naukowe w Instytucie Immunologii i Terapii Doświadczalnej im. Ludwika Hirszfelda Polskiej Akademii Nauk.”

 

 

INFORMACJE DOTYCZĄCE PRZETWARZANIA DANYCH OSOBOWYCH

Administratorem Państwa danych przetwarzanych w ramach procesu rekrutacji jest:

Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej PAN we Wrocławiu

  1. R. Weigla 12 53-114 Wrocław,

dalej IITD PAN lub Administrator

Mogą się Państwo kontaktować z wyznaczonym inspektorem ochrony danych osobowych pod adresem:

  • Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej PAN we Wrocławiu ul. R. Weigla 12 53-114 Wrocław, tel. 71 370 99 40
  • e-mail: iod@hirszfeld.pl

Cel i podstawy przetwarzania:

Państwa dane osobowe w zakresie wskazanym w przepisach prawa pracy –  art. 22¹ ustawy z 26 czerwca 1974 r. Kodeks pracy (Dz. U. 2018 poz. 917 ze zm.) oraz na podstawie art. Art. 91 ust. 5 Ustawy o Polskiej Akademii Nauk z dnia 30 kwietnia 2010 r., (Dz. U. Nr 96, poz. 619, z późn. zm.)  będą przetwarzane w celu przeprowadzenia obecnego postępowania rekrutacyjnego (art. 6 ust. 1 lit. b i c).

Podanie przez Państwa danych osobowych w zakresie wynikającym z art. 22¹ Kodeksu pracy jest niezbędne, aby uczestniczyć w postępowaniu rekrutacyjnym.

Podanie innych danych w zakresie nieokreślonym przepisami prawa, zostanie potraktowane jako zgoda (art. 6 ust. 1 lit a RODO) na przetwarzanie tych danych osobowych. Wyrażenie zgody w tym przypadku jest dobrowolne, a zgodę tak wyrażoną można odwołać w dowolnym czasie. Dane adresowe podane są powyżej.

Jeżeli w dokumentach zawarte są dane, o których mowa w art. 9 ust. 1 RODO konieczna jest Państwa zgoda na ich przetwarzanie (art. 9 ust. 2 lit. a RODO) , która może zostać odwołana w dowolnym czasie. Dane adresowe podane są powyżej.

Odbiorcy danych osobowych:

Państwa dane osobowe mogą być przekazane wyłącznie podmiotom, które uprawnione są do ich otrzymania przepisami prawa. Ponadto mogą być one ujawnione podmiotom, z którymi Administrator zawarł umowę na świadczenie usług i stosowną umowę powierzenia.

Okres przechowywania danych:

Państwa dane zgromadzone w obecnym procesie rekrutacyjnym będą przechowywane do czasu zakończenia procesu rekrutacji, a następnie przez 3 lata do czasu przedawnienia roszczeń.

Mają Państwo prawo do:

1)      dostępu do swoich danych oraz otrzymania ich kopii

2)      sprostowania (poprawiania) swoich danych osobowych;

3)      ograniczenia przetwarzania danych osobowych;

4)      usunięcia danych osobowych;

5)      wniesienia skargi do Prezes UODO, na adres Urzędu Ochrony Danych Osobowych, ul. Stawki 2, 00 – 193 Warszawa.

[1] Może być istotne przy zadudnieniach z projektu

[2] Można modyfikować w zależności od wymagań stanowiska, przy czym należy uwzględnić wymagania opisane w Załączniku nr 1 Regulaminu przeprowadzania konkursów na stanowiska naukowe w IITD PAN.

[3] Do modyfikacji przez Wnioskodawcę w zależności od stanowiska i wymagań