25. Konkurs na stanowisko adiunkta K/M w Laboratorium Genomiki i Bioinformatyki

 

KONKURS NA STANOWISKO

ADIUNKTA 

W INSTYTUTCIE IMMUNOLOGII I TERAPII DOŚWIADCZALNEJ

im. Ludwika Hirszfelda

POLSKIEJ AKADEMII NAUK WE WROCŁAWIU

 

 

A. INFORMACJE OGÓLNE DOTYCZĄCE STANOWISKA PRACY

  1. Stanowisko: K/M adiunkt
  2. Liczba stanowisk objętych konkursem 1
  3. Jednostka organizacyjna Instytutu Laboratorium Genomiki i Bioinformatyki
  4. Źródło finansowania środki instytutowe
  5. Wynagrodzenie brutto 7729,3 zł, zgodnie z regulaminem wynagradzania IITD PAN
  6. Rozdaj umowy umowa o pracę na czas nieokreślony
  7. Wymiar zatrudnienia 1/1 etatu
  8. Okres zatrudnienia od 10.2026
  9. Proponowany termin rozpoczęcia pracy 10.2026

B. OPIS ZADAŃ NA STANOWISKU

  1. Analizy NGS, genomika i transkryptomika
    1. Prowadzenie badań naukowych w bioinformatyce, genomice, transkryptomice i biologii molekularnej, ze szczególnym uwzględnieniem danych NGS.
    2. Planowanie, wykonywanie i interpretacja analiz bioinformatycznych, w tym RNA-seq (ekspresja genów i transkryptów, alternatywne składanie, izoformy) oraz analiz genomowych i transkryptomicznych, w tym identyfikacji wariantów genetycznych i integracji danych molekularnych, biologicznych i klinicznych.
    3. Konsultowanie projektów badawczych w zakresie projektowania eksperymentów, doboru metod sekwencjonowania oraz oceny jakości i możliwości analizy danych.
  1. Pipeline’y bioinformatyczne i infrastruktura HPC
    1. Opracowywanie, optymalizacja i wdrażanie pipeline’ów bioinformatycznych do analizy danych NGS, obejmujących kontrolę jakości, automatyzację, analizę dużych zbiorów danych oraz wykorzystanie infrastruktury HPC.
    2. Rozwój i wdrażanie nowych metod analizy danych oraz rozwijanie infrastruktury bioinformatycznej Instytutu.
    3. Dokumentowanie analiz oraz zapewnienie ich powtarzalności i właściwego przechowywania danych, kodu i wyników zgodnie z dobrą praktyką naukową.
    4. Stałe podnoszenie kwalifikacji oraz wdrażanie nowych narzędzi i metod w bioinformatyce i biologii obliczeniowej.
  1. Immunologia, TCR/BCR i terapie komórkowe
    1. Analizy repertuarów TCR/BCR oraz badania odpowiedzi immunologicznej, w tym w kontekście immunologii nowotworów.
    2. Wsparcie bioinformatyczne badań nad terapiami, w tym CAR-T i terapiami komórkowymi, poprzez analizę danych molekularnych, charakterystykę konstruktów genetycznych i ocenę wyników sekwencjonowania.
  1. Publikacje, granty i upowszechnianie wyników
    1. Opracowywanie wyników badań, analiz statystycznych i wizualizacji oraz przygotowywanie publikacji, raportów, prezentacji i wystąpień konferencyjnych.
    2. Udział w przygotowywaniu publikacji naukowych i wniosków grantowych, w tym opracowywanie koncepcji badań, metodologii i planów analiz oraz interpretacja danych.
  1. Współpraca, projekty i organizacja badań
    1. Współpraca z zespołami badawczymi w zakresie planowania eksperymentów NGS, doboru metod analitycznych oraz interpretacji wyników.
    2. Udział w krajowych i międzynarodowych projektach badawczych oraz współpraca interdyscyplinarna w obszarach bioinformatyki, genomiki, biologii molekularnej, immunologii i onkologii.
    3. Wykonywanie innych zadań naukowych i organizacyjnych związanych z realizacją projektów i działalnością jednostki.

 

C. WYMAGANIA STAWIANE KANDYDATOM

  1. Wymagania formalne i merytoryczne które powinien spełnić Kandydat (zgodnie z § 4 ust 3 lit k oraz § 4 ust 4 Regulaminu przeprowadzania konkursów na stanowiska naukowe w IITD PAN)

Kandydat aplikujący na ogłaszane stanowisko naukowe powinien wykazywać się silną motywacją do pracy naukowej, umiejętnością pracy w zespole, samodzielnością, odpowiedzialnością i zaangażowaniem w realizację zaplanowanych zadań.

W szczególności Kandydat powinien[1]:

  • posiadać tytuł lub stopień w dziedzinie nauk ścisłych i przyrodniczych lub nauk medycznych i nauk o zdrowiu w dyscyplinie nauki biologiczne lub biologia medyczna,
  •  posiadać co najmniej  10  letnie doświadczenie pracy naukowej (razem z doktoratem), obejmujące prowadzenie badań z wykorzystaniem metod bioinformatycznych i biologii obliczeniowej wykorzystując narzędzia służące do powtarzalności uzyskiwanych wyników
  • posiadać wiedzę i doświadczenie w planowaniu i prowadzeniu badań naukowych w zakresie genomiki, transkryptomiki, bioinformatyki i biologii molekularnej, w szczególności badań wykorzystujących wysokoprzepustowe technologie sekwencjonowania oraz doświadczenie we współpracy z zespołami eksperymentalnymi, obejmujące planowanie eksperymentów NGS, dobór metod analitycznych oraz interpretację wyników
  • posiadać wiedzę i doświadczenie w zakresie zastosowania narzędzi bioinformatycznych do analiz NGS, w szczególności danych RNA-seq obejmujące kontrolę jakości danych, mapowanie odczytów, analizę ekspresji genów i transkryptów, analizę alternatywnego składania RNA oraz interpretację biologiczną uzyskanych wyników, a także doświadczenie w pracy z narzędziami i środowiskami wykorzystywanymy w bioinformatycze, w szczególności R, Python, bash, systemami Linux oraz środowiskami obliczeniowymi HPC, jak również w tworzeniu, modyfikowaniu i automatyzacji protokołów analitycznych, w tym z wykorzystaniem systemów zarządzania workflow (np. Nextflow, Snakemake)
  • wykazać czynny udział w życiu naukowym udokumentowany przedstawieniem wyników własnych badań w publikacjach naukowych, w tym przynajmniej w 1 publikacjach oryginalnych posiadających IF w których Kandydat jest autorem pierwszym/równorzędnym z pierwszym/ostatnim opublikowanych w okresie 5 lat przed złożeniem aplikacji w konkursie
  • udokumentować czynny udział w realizacji projektów naukowych w roli wykonawcy/kierownika projektów
  •  wykazać udział w opiece nad młodszą kadrą naukową
  • udokumentować odbyte staże naukowe lub pracę w więcej niż jednej jednostce naukowej/badawczej
  • przedstawić prowadzone, udokumentowane współprace naukowe,
  • udokumentować kierowanie pracą zespołu realizującego badania naukowe
  • wykazać czynny udział w popularyzacji nauki
  • posługiwać się językiem angielskim w mowie i piśmie,
  1. Dodatkowe umiejętności i doświadczenie kandydata mile widziane na stanowisku (zgodnie z § 4 ust 3 lit k Regulaminu przeprowadzania konkursów na stanowiska naukowe w IITD PAN)
  • doświadczenie w analizie repertuarów receptorów limfocytów T i/lub B (TCR/BCR) oraz analizie danych związanych z charakterystyką odpowiedzi immunologicznej;
  • doświadczenie w analizie danych pochodzących z badań onkologicznych, immunologicznych lub dotyczących terapii komórkowych, w tym terapii CAR-T;
  • doświadczenie w przygotowywaniu wniosków grantowych oraz opracowywaniu części bioinformatycznych, analitycznych lub metodologicznych w projektach badawczych.

 

D. WYKAZ DOKUMENTÓW WYMAGANYCH OD KANDYDATA[2]:

Szczegółowe rekomendacje minimalnych wymagań formalnych stawianych osobom ubiegającym się w drodze konkursu o zatrudnienie na stanowiskach naukowych w Instytucie Immunologii i Terapii Doświadczalnej PAN są określone w Załączniku nr 1 Regulaminu przeprowadzania konkursów na stanowiska naukowe w IITD PAN. Ocena Kandydatów zostanie przeprowadzona w oparciu o Formularz Oceny Kandydata (Załącznik nr 2 do Regulaminu).

  1. kopia dyplomu poświadczająca uzyskanie tytułu zawodowego lub stopnia naukowego lub tytułu profesora w dziedzinach i dyscyplinach nauk wskazanych w konkursie
  2. list motywacyjny
  3. CV przedstawiające sylwetkę naukową kandydata (m.in. przebieg kariery zawodowej, przerwy w karierze, jeśli kandydat uzna za zasadne je podać, publikacje z opisem wkładu kandydata w ich powstanie, odbyte praktyki, staże, szkolenia, warsztaty, udział w realizacji lub kierowanie grantami, opieka nad młodszą kadrą naukową, promotorstwo doktorantów, popularyzacja nauki).
  4. opis najważniejszego osiągnięcia naukowego/najważniejszych osiągnięć naukowych
  5. przedstawić plan badawczy
  6. Inne dokumenty potwierdzające wymagania (np. listy polecające, certyfikaty etc.)

F. INFORMACJE DOTYCZACE TERMINÓW I TRYBU SKŁADANIA DOKUMENTÓW I KONTAKTU Z KANDYDATAMI

Konkurs jest prowadzony zgodnie z Regulaminem przeprowadzania konkursów na stanowiska naukowe w Instytucie Immunologii i Terapii Doświadczalnej im. Ludwika Hirszfelda Polskiej Akademii Nauk. Dokumentacja konkursowa dostępna jest na stronie  https://hirszfeld.pl/instytut/oferty-pracy/zasady-zatrudniania-na-stanowiskach-naukowych/

Zgłoszenia zawierające komplet dokumentów powinny zostać dostarczone do dnia 11 września 2026 r. do godz. 10:00 pocztą elektroniczną na adres kadry@hirszfeld.pl  lub lukasz.laczmanski@hirszfeld.pl  (tytuł aplikacji: adiunkt LGiB). Kontakt z Kandydatami będzie się odbywał za pośrednictwem poczty elektronicznej na adres, z którego zostanie wysłane zgłoszenie lub w inny, uzgodniony z Kandydatem sposób.

Informujemy, że skontaktujemy się z wybranymi Kandydatami, którzy zostaną zaproszeni na rozmowę kwalifikacyjną (osobiście lub on-line). Rozstrzygnięcie konkursu nastąpi do dnia 22 września 2026, a o wynikach konkursu Kandydaci zostaną powiadomieni pocztą elektroniczną. Komisja zastrzega sobie prawo do nie wybrania żadnego z Kandydatów w drodze konkursu. W takim przypadku konkurs może zostać/zostanie ogłoszony ponownie.

Jeśli Kandydat wyraża zgodę na wykorzystanie zgłoszenia w następnych naborach, prosimy o dołączenie oświadczenia o treści „Wyrażam zgodę na przechowywanie dokumentów i ich wykorzystanie w następnych naborach zgodnie z § 11 ust. 2 Regulaminu przeprowadzania konkursów na stanowiska naukowe w Instytucie Immunologii i Terapii Doświadczalnej im. Ludwika Hirszfelda Polskiej Akademii Nauk.”

 

 

INFORMACJE DOTYCZĄCE PRZETWARZANIA DANYCH OSOBOWYCH

Administratorem Państwa danych przetwarzanych w ramach procesu rekrutacji jest:

Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej PAN we Wrocławiu

  1. R. Weigla 12 53-114 Wrocław,

dalej IITD PAN lub Administrator

Mogą się Państwo kontaktować z wyznaczonym inspektorem ochrony danych osobowych pod adresem:

  • Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej PAN we Wrocławiu ul. R. Weigla 12 53-114 Wrocław, tel. 71 370 99 40
  • e-mail: iod@hirszfeld.pl

Cel i podstawy przetwarzania:

Państwa dane osobowe w zakresie wskazanym w przepisach prawa pracy –  art. 22¹ ustawy z 26 czerwca 1974 r. Kodeks pracy (Dz. U. 2018 poz. 917 ze zm.) oraz na podstawie art. Art. 91 ust. 5 Ustawy o Polskiej Akademii Nauk z dnia 30 kwietnia 2010 r., (Dz. U. Nr 96, poz. 619, z późn. zm.)  będą przetwarzane w celu przeprowadzenia obecnego postępowania rekrutacyjnego (art. 6 ust. 1 lit. b i c).

Podanie przez Państwa danych osobowych w zakresie wynikającym z art. 22¹ Kodeksu pracy jest niezbędne, aby uczestniczyć w postępowaniu rekrutacyjnym.

Podanie innych danych w zakresie nieokreślonym przepisami prawa, zostanie potraktowane jako zgoda (art. 6 ust. 1 lit a RODO) na przetwarzanie tych danych osobowych. Wyrażenie zgody w tym przypadku jest dobrowolne, a zgodę tak wyrażoną można odwołać w dowolnym czasie. Dane adresowe podane są powyżej.

Jeżeli w dokumentach zawarte są dane, o których mowa w art. 9 ust. 1 RODO konieczna jest Państwa zgoda na ich przetwarzanie (art. 9 ust. 2 lit. a RODO) , która może zostać odwołana w dowolnym czasie. Dane adresowe podane są powyżej.

Odbiorcy danych osobowych:

Państwa dane osobowe mogą być przekazane wyłącznie podmiotom, które uprawnione są do ich otrzymania przepisami prawa. Ponadto mogą być one ujawnione podmiotom, z którymi Administrator zawarł umowę na świadczenie usług i stosowną umowę powierzenia.

Okres przechowywania danych:

Państwa dane zgromadzone w obecnym procesie rekrutacyjnym będą przechowywane do czasu zakończenia procesu rekrutacji, a następnie przez 3 lata do czasu przedawnienia roszczeń.

Mają Państwo prawo do:

1)      dostępu do swoich danych oraz otrzymania ich kopii

2)      sprostowania (poprawiania) swoich danych osobowych;

3)      ograniczenia przetwarzania danych osobowych;

4)      usunięcia danych osobowych;

5)      wniesienia skargi do Prezes UODO, na adres Urzędu Ochrony Danych Osobowych, ul. Stawki 2, 00 – 193 Warszawa.

[1] Można modyfikować w zależności od wymagań stanowiska, przy czym należy uwzględnić wymagania opisane w Załączniku nr 1 Regulaminu przeprowadzania konkursów na stanowiska naukowe w IITD PAN.

[2] Do modyfikacji przez Wnioskodawcę w zależności od stanowiska i wymagań