Miło nam poinformować, że w czasopiśmie Science of The Total Environment (IF 8,2; pkt. MNiSW 200) ukazał się artykuł, którego współautorem jest dr hab. Łukasz Łaczmański, kierownik Laboratorium Genomiki i Bioinformatyki.

Sobieraj K, Żebrowska-Różańska P, Siedlecka A, Łaczmański Ł, Białowiec A. Analysis of microbial community potentially involved in carbon monoxide production in compost and its functional assessment: Utilized pathways, enzymes, and genes. Sci Total Environ. 2025 Mar 10;968:178860. doi: 10.1016/j.scitotenv.2025.178860

Badanie analizuje możliwość biologicznej produkcji tlenku węgla (CO) podczas kompostowania odpadów organicznych, zgodnie z zasadami bioekonomii. Wykorzystano sekwencjonowanie 16S rDNA do charakterystyki mikroorganizmów w dwóch strefach pryzmy kompostowej o niskim (119 ppm) i wysokim (785 ppm) stężeniu CO. Analiza funkcjonalna przy użyciu PICRUSt2 wykazała większą różnorodność mikrobiologiczną w strefie o wysokim CO, prawdopodobnie ze względu na niższą temperaturę (50°C vs. 62°C). Główną grupą mikroorganizmów były Bacilli, dominujące w CO/L (98,8%) i obecne w CO/H (55,4%). Kluczowym odkryciem było zidentyfikowanie szlaku Wooda-Ljungdahla, odpowiadającego za produkcję CO. Badanie po raz pierwszy podkreśliło potencjał kompostowania jako zrównoważonej metody wytwarzania CO i potwierdziło PICRUSt2 jako niezawodne narzędzie do odkrywania biotycznych mechanizmów produkcji CO, oferując cenny wstępny wgląd w możliwości funkcjonalne społeczności drobnoustrojów.

Pracownicy Laboratorium Genomiki i Bioinformatyki IITD PAN w opisywanym projekcie wykorzystali opracowaną unikatową metodę identyfikacji genu 16S rRNA wraz z analizą bioinformatyczną umożliwiającą ustalenie ilościowe składu mikroorganizmów oraz analizę szlaków metabolicznych.

Link do publikacji: https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2025.178860